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Die 7 besten Molekularmodellierungssoftware für die Chemie 2024

Einleitung

3D-Modellierungssoftware ist ein leistungsstarkes Werkzeug, mit dem viele Fachleute komplexe 3D-Grafiken erstellen und ihre Arbeit visualisieren können. Im Bereich der Chemie gibt es verschiedene Software für die molekulare Modellierung und Visualisierung, aber welche ist die beste? Einige Chemiesoftware eignet sich besser zum Zeichnen chemischer Reaktionen, andere wiederum finden bessere Anwendungen bei der Simulation von Proteinstrukturen und es gibt auch Software für die Molekülmodellierung und -Visualisierung. In diesem Artikel haben wir eine Zusammenstellung der besten Molekülmodellierungssoftware für die Chemie zusammengestellt, die Sie auf dem Markt finden können und dabei ihr Potenzial und ihre wichtigsten Funktionen erwähnt. Gehen wir sie der Reihe nach durch!

Die 7 besten Programme für die Molekularmodellierung

Im Folgenden werden wir die sieben besten Molekülmodellierungssoftware für die Chemieindustrie vorstellen.

Molekülmodellierungssoftware #1: ChemDoodle

ChemDoodle ist ein chemischer Skizzenzeichner, der viele Funktionen für die Arbeit mit chemischen Grafiken enthält. Diese Molekularmodellierungssoftware für die Chemie ist eine der besten, die Sie auf dem Markt finden können. Sie hat eine sehr benutzerfreundliche UI (Users Interface), die von Schülern bis hin zu Chemieingenieuren verwendet werden kann. ChemDoodle kann chemische 3D-Strukturen mit hochwertigen 3D-Grafiken erstellen und Reaktionsschemata in Echtzeit erstellen und verwalten.

ChemDoodle wird mit einigen Software-Tools geliefert, die “Widgets” genannt werden. Dabei handelt es sich um Minianwendungen, die verschiedene Aufgaben erfüllen und zur Erstellung der Molekülgrafiken beitragen. Solche Aufgaben können die Berechnung von Molekülmassen, die Durchführung von Elementaranalysen, die Suche in Datenbanken nach chemischen Strukturen usw. sein. Darüber hinaus enthält ChemDoodle eine Visualisierungsplattform, ChemDoodle 3D genannt, welche die chemischen 2D-Strukturen in individuelle 3D-Modelle umwandelt.

Die Software ist mit Windows, Mac OS X und Linux kompatibel. Sie ist auch für Smartphones verfügbar, so dass Sie Ihre 3D-Designs zwischen Desktop und Handy übertragen können.

Molekülmodellierungssoftware #2: Hypercube

Hypercube ist eine Molekülmodellierungssoftware, die aufgrund ihrer Funktionalität und ihrer benutzerfreundlichen Oberfläche von vielen Chemikern verwendet wird. Das Hauptpaket dieser Moleküldesignsoftware ist “HyperChem”. Die Software “HyperChem” unterstützt viele Funktionen im Zusammenhang mit dem chemischen 3D-Design, wie z. B. Proteinsimulationen, Molekülmodellierung, Molekülvisualisierung, Berechnungen chemischer Strukturen und andere Operationen im Zusammenhang mit der Bioinformatik.

Hypercube bietet verschiedene andere spezialisierte Molekularmodellierungssoftware an, je nach Ihrem Tätigkeitsbereich in der Chemie. Eine davon ist die Software “HyperProtein”, die sich auf die Modellierung von Proteinen konzentriert. Abgesehen von den Hauptfunktionen im Zusammenhang mit der Modellierung und Simulation, welche die HyperChem-Software bieten kann, umfasst sie auch Software für das Sequenz-Alignment und die Erstellung phylogenetischer Bäume für Proteinfamilien.

Molekülmodellierungssoftware #3: Avogadro

Eine weitere Software für die molekulare Modellierung in der Chemie, die Sie vielleicht leicht verwenden können, ist Avogadro.

Avogadro ist eine Software, die den Import von Chemiedateien unterstützt und mehrere Berechnungspakete für die Chemie erstellt. Avogadro wird in vielen wissenschaftlichen Bereichen eingesetzt, z. B. in der computergestützten Chemie, der Molekularmodellierung, der Bioinformatik und der Materialwissenschaft, von Studenten bis hin zu erfahrenen Chemikern. Einer der Hauptvorteile dieser Software ist, dass sie ein flexibles, qualitativ hochwertiges Rendering und fortgeschrittene Funktionen für die Bearbeitung von Molekülen bietet.

Molekülmodellierungssoftware #4: ChemAxon

ChemAxon ist ein Toolkit zur Darstellung chemischer Strukturen, das Sie als Chemieingenieur oder sogar als Chemiestudent sehr nützlich finden können. Die Software verfügt über zwei Hauptfunktionen, die in zwei einzelnen Anwendungen untergebracht sind. Die erste dieser Funktionen heißt “Standardizer” und hilft Ihnen dabei, Ihre chemischen Strukturen in maßgeschneiderte 3D-Moleküldarstellungen zu verwandeln. Abgesehen von den vielen vordefinierten Aktionen, welche die Anwendung bietet, kann der Benutzer auch eigene implementieren. Die andere wichtige Funktion dieser Design-Software für die Chemie heißt “Structure Checker”. Diese Anwendung bietet Ihnen die Möglichkeit, alle Probleme, die Sie mit der Struktur der Moleküldarstellung haben könnten, zu bearbeiten und zu ändern. Sie durchsucht die Moleküle nach strukturellen Problemen und sobald ein Fehler gefunden wird, bietet die Software automatisch eine Lösung in Echtzeit. “Structure Checker” ist ein sehr nützliches Werkzeug, das jeder Benutzer von chemischen Zeichnungen zu schätzen weiß, da es Fehler und falsche Merkmale aufspürt, insbesondere wenn ein neues Molekül zum Zeichenbereich hinzugefügt wird.

Molecular modeling software

“Standardizer” feature – chemaxon

molecular design software

“Structure Checker” feature – chemaxon

Molekülmodellierungssoftware #5: BIOVIA Draw

BIOVIA Draw ist eine Software zum Zeichnen von Molekülen, die sich vor allem an Chemiker und erfahrene Fachleute aus der chemischen Industrie richtet. Sie bietet Wissenschaftlern ein komplettes Set von Werkzeugen zum Zeichnen und Modifizieren von komplexen Molekülen, chemischen Reaktionen und biologischen Sequenzen. Die Oberfläche ist leicht zu erlernen und bietet die Möglichkeit, wissenschaftliche Informationen zu betrachten, zu kommunizieren und zu archivieren.

Kostenlose Molekularmodellierungssoftware für die Chemie

Kostenlose Molekularmodellierungssoftware für die Chemie

Molekülmodellierungssoftware #6: MolView

MolView ist eine Modellierungssoftware für die Chemie mit einer ganz anderen Schnittstelle als die anderen oben genannten Pakete. Der Hauptunterschied besteht in der Tatsache, dass es sich um eine kostenlose Online-Anwendung handelt. Es ist ein sehr einfach zu bedienendes Programm, auch wenn Sie noch keine Erfahrung mit 3D-Modellierungssoftware haben.

Diese Open-Source-Webanwendung kann sowohl als molekularer Editor als auch als 3D-Modellbetrachter verwendet werden. Als Benutzer können Sie Moleküle aus großen Datenbanken wie PubChem, RCSB Protein Data Bank und der Crystallography Open Database hochladen.

Mit MolView können Sie nicht nur Strukturformeln erstellen, sondern es auch für die Darstellung von Proteinen, die Modellierung und Simulation des Zusammenbaus von Proteinen und die Darstellung von Ketten verwenden. Nicht zuletzt können Sie auch verschiedene Arten von Daten im PNG-Format (als Schnappschuss aus dem interaktiven Spektrum) oder im JCAMP-Dateiformat (JCAMP-DX-Datei des aktuellen Spektrums) exportieren.

Molekülmodellierungssoftware #7: ACD/ChemSketch

ACD/ChemSketch ist ein chemisches Zeichnungspaket, das Sie entweder kostenlos herunterladen oder kaufen können, wenn Sie es für kommerzielle Zwecke nutzen möchten. Beachten Sie jedoch, dass die kostenlose Version von ChemSketch nicht alle Funktionen der kommerziellen Version enthält. Es handelt sich jedoch um eine ziemlich vollständige Software, die für Bildungszwecke verwendet werden kann, entweder von Schülern oder von Chemiestudenten im Grundstudium.

Mit dieser Software können Sie organisch-chemische Strukturen, Strukturen von Organometallen, Polymere und Markush-Strukturen zeichnen. Als Benutzer haben Sie auch die Möglichkeit, molekulare Eigenschaften wie Molekulargewicht, Dichte, molare Refraktion usw. zu berechnen. Es ist auch möglich, Ihren 2D-Moleküldesign in 3D zu betrachten, um die entworfene Struktur besser zu visualisieren.

Für welche Molekularmodellierungssoftware entscheiden Sie sich?

Wenn Sie sich mit Molekülmodellierungssoftware für die Chemie vertraut machen möchten, werden Sie die Software finden, die am besten zu Ihnen passt. Von Software für die 3D-Modellierung und Simulation chemischer Strukturen bis hin zu Simulationspaketen hat der Markt viele Optionen zu bieten.

Wir hoffen, dass Sie diese Sammlung von Software für die Chemie nützlich finden. Wenn Sie immer über die neuesten Modellierungssuiten und Softwaretools auf dem Laufenden sein wollen, abonnieren Sie unseren Newsletter, um die neuesten Nachrichten aus dem Bereich der Technologie zu erhalten.

Photo Credits: molview.org

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